Black Mesa est un remaster créé par des fans qui intègre tous les éléments de gameplay de Half-Life dans le nouveau moteur sans ajouter de nouveaux ennemis, personnages ou armes au jeu. Parallèlement, Black Mesa utilise également ses propres objets, comme de nouveaux modèles de jeux et de la musique indépendante.

Le mod s'appelait Black Mesa : Source, mais à la demande de Valve, il a été renommé Black Mesa. Les travaux sur le projet se sont poursuivis et la date de sortie a été régulièrement retardée, jusqu'à ce qu'en 2012 une version incomplète du jeu soit créée, dans laquelle il manquait encore les derniers chapitres de l'histoire consacrés au monde de Xen.